性器官先天性畸形：
男性的严重睾丸发育不良、重度尿道下裂，女性的处女膜闭锁、处女膜肥厚等都无法完成性生活。
性器官急性炎症：
男性的睾丸炎、附睾炎、精索炎、前列腺炎、精囊炎等，以及女性的外阴炎、阴道炎、子宫颈炎等，只要是急性发作状态，都不宜有性生活。因为性交时性器官高度充血与水肿，同房只会加重病情，增加不适。
性器官的特殊感染：
结核、性病、滴虫病等感染，都应治愈后才可行房事，否则一来会加重病情，二来也会使配偶传染上。
某些性器官肿瘤：
男性患阴茎癌、睾丸肿瘤、前列腺癌，女性患子宫颈癌与外阴癌等肿瘤时，必须停止性生活，否则会增加肿瘤细胞在血液与淋巴循环中播散的几率，而且对伴侣健康也不利。
性器官皮肤病：
因为不洁性生活或者间接传染导致的性器官皮肤病，如阴囊湿疹等，会因房事而增加继发细菌感染的机会，所以至少要在病情基本控制后才行房事。
对于女性来说，还有些特殊问题也不宜进行性生活：
严重的月经不调：
经期延长，经血量大，周期特别紊乱时，最好调经后再恢复性生活，否则在性刺激的影响下，有时月经不调现象反而会加重。
习惯性流产者：
习惯性流产的原因很复杂，但有时也与妊娠后的不当性交有关，所以习惯性流产的妇女一旦再次怀孕，要绝对禁止性交。
